在建筑上，海会寺采用传统的中轴线对称布局，从南向北依次为山门、前殿、中殿、大雄宝殿。前殿即天王殿，共三间，殿两侧建有钟鼓二楼。中殿即千佛殿，为穿堂式建筑，共三间，供弥勒佛和观音菩萨。大雄宝殿，也称三殿，面阔五间，进深三间，是寺内主体建筑。寺院占地100余亩，殿字楼阁168间，各种佛像500 尊，常住僧侣40余人。寺院内有近千年古树三棵，百年以上古树近十多棵。
上世纪90年代末，经阳谷县两委研究决定，将海会寺归还佛教界，并予以开放为宗教活动场所，仁修法师于2000年1 月入住海会寺并展开海会寺的修复工作。在短短一年的时间内，就筹集了资金六十余万元，并于当年完成了大雄宝殿的修复工程。重修后的大雄宝殿，金碧辉煌，佛像高耸，梵宇清磬，晨钟暮鼓，俨然一片清平气象。
